Bifidobacterium favimelis sp. nov. IMAU50987^(T)碳源代谢差异的基因组学基础分析OA
研究从中国云南省黑蜂巢蜂蜜中分离出的一株双歧杆菌属新种Bifidobacterium favimelis sp.nov. IMAU50987^(T)。API 50 CHL结果表明,该菌株可利用蔗糖、麦芽糖、淀粉等11种碳源,偏好多糖和寡糖而非单糖,与近缘菌株的碳源利用存在差异。为解析造成这种差异的遗传基础,该文对该菌株及其近缘种进行比较基因组学分析,利用Roary构建核-泛基因集,采用直系同源簇数据库(cluster of orthologous groups of proteins, COG)、碳水化合物活性酶数据库(carbohydrate-active enzymes database, CAZy)和KEGG进行功能注释。COG注释结果表明:B.asteroides组菌株碳水化合物运输和代谢相关的基因占主导;CAZy分析共注释到3大类碳水化合物活性酶的25个亚类基因家族,其中可特异性结合糖原或淀粉颗粒的CBM48结构域为IMAU50987^(T)特有。KEGG结果表明,该菌株在碳水化合物代谢二级通路中注释到的基因最多,主要集中于淀粉与蔗糖代谢及糖酵解/糖异生通路,且拥有sucP、cbpA_2、pulA等特有基因。毒力与耐药基因分析显示,该菌株在基因水平上具有安全性。IMAU50987^(T)独特的碳源利用特性使其在具有复杂糖类的环境中具有较强的竞争优势,为该菌株的应用提供了数据和研究基础。
宋秋婕;李瑜;刘文俊
内蒙古农业大学,乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018 内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室,内蒙古呼和浩特010018 农业农村部奶制品加工重点实验室,内蒙古呼和浩特010018 国家饲料微生物种质资源库,内蒙古呼和浩特010018内蒙古农业大学,乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018 内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室,内蒙古呼和浩特010018 农业农村部奶制品加工重点实验室,内蒙古呼和浩特010018 国家饲料微生物种质资源库,内蒙古呼和浩特010018内蒙古农业大学,乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018 内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室,内蒙古呼和浩特010018 农业农村部奶制品加工重点实验室,内蒙古呼和浩特010018 国家饲料微生物种质资源库,内蒙古呼和浩特010018
轻工纺织
双歧杆菌碳源代谢功能基因比较基因组学蜂蜜
《食品与发酵工业》 2026 (13)
P.20-29,I0018-I0020,13
内蒙古自然科学基金杰出青年基金项目(2023JQ07)内蒙古自治区高等学校青年科技英才项目(NYT22042)。
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