凝结海恩德里克斯氏菌特异性鉴定引物开发OA

该文旨在建立一种针对凝结海恩德里克斯氏菌的高效、简便且低成本的特异性PCR鉴定方法。凝结海恩德里克斯氏菌现有的鉴定技术,如16S rRNA测序和生理生化试验等,普遍存在检测成本较高或周期长的局限;而以往报道的特异性PCR鉴定引物,随着该菌属名的2次变更,其引物特异性在现行分类框架下亟待重新验证。该研究利用Roary 3.31.0等工具对海恩德里克斯氏属及其近缘芽孢杆菌属的183个基因组进行泛基因组分析,筛选出9个凝结海恩德里克斯氏菌特异性基因,并据此设计10对引物。经35株阴性菌和25株阳性菌的验证,靶向冷激蛋白基因的引物SCFF-WCYW008表现出100%的扩增特异性,在退火温度50~60℃、DNA模板质量浓度≥0.96 ng/μL条件下扩增效果良好。该研究基于生物信息学所开发的引物具有高特异性和灵敏度,可显著缩短鉴定时间、降低检测成本,并为其他菌种特异性引物的开发提供了技术参考。