金银花WRKY转录因子家族响应白粉病的转录组分析OA

以金银花‘郑银花3号’为试材,对由忍冬叉丝壳菌引起的白粉病感病叶片和健康叶片进行转录组测序分析,并对转录因子WRKY进行筛选与鉴定,利用生物信息学方法对其蛋白理化性质、序列比对、进化关系以及表达模式进行分析,以期为探索金银花WRKY转录因子抗白粉病的调控机制提供参考依据。结果表明:金银花基因组中鉴定得到32个WRKY家族成员,编码氨基酸的数目在164~748 aa,蛋白分子量在17683.53~80967.23 Da,LjWRKY蛋白的理论等电点的范围为4.96~9.71,其中有18个蛋白呈酸性,14个蛋白呈碱性,且均为亲水性蛋白。根据基序分析发现,出现频率最高的是Motif 1和Motif 2,推测其是金银花WRKY中的保守基序。在聚类分析中,多个LjWRKY与ATWRKY聚为一类,因而可以推测其具有相似的生物学功能。在WRKY家族的表达分析中,发现有11个基因在DL中的表达量发生了明显上调,其中Lj3C833T11、Lj7A731T27和Lj5C246T14的表达差异最大,这些WRKY基因可能参与了金银花响应白粉病的过程。