中国樱桃Dof基因家族鉴定及其表达分析OA

以中国樱桃(Prunus pseudocerasus(Lindl.)G.Don)为试材,采用全基因组筛选鉴定、生物信息学分析(系统进化、保守结构域、顺式作用元件、共线性分析)及转录组表达分析方法,研究了中国樱桃Dof转录因子家族的全基因组特征、进化规律及其在果实发育中的表达模式与功能特征,以期为解析中国樱桃Dof基因在果实成熟发育中的调控机制提供参考依据。结果表明:中国樱桃全基因组中鉴定出25个Dof家族基因(PpsDof1~PpseDof25),不均匀分布于8条染色体;编码蛋白长度143~623 aa,等电点5.59~10.10,均为亲水性蛋白。系统进化将其分为9个亚族(A、B1、B2、C1、C2.1、C2.2、C3、D1、D2),所有成员均含保守C 2-C 2结构域,启动子富集激素、光响应及胁迫响应顺式作用元件;家族内存在17对片段复制基因,是其扩张的主要方式。转录组显示,2个品种果实发育中Dof基因表达模式整体相似,PpseDof12、PpseDof24、PpseDof23在绿果期高表达,随成熟显著下调,可能负调控果实成熟软化;PpseDof2、PpseDof6、PpseDof25随果实发育持续上调,正调控果实成熟进程。