2022—2024年温州地区食品和临床来源单增李斯特菌全基因组测序及毒力/耐药基因特征分析OA

目的分析温州地区单增李斯特菌(Listeria monocytogenes)的分子特征,为该地区的食品风险评估提供依据。方法对80株本地食品与临床来源的分离株进行全基因组测序;利用生物信息学方法分析谱系、序列型(ST型)、克隆群(CC型)、毒力基因和耐药基因;并通过全基因组单核苷酸多态性系统发育树(wg-SNP)解析菌株的遗传进化关系。结果基因组分析显示,80株菌分属于2个谱系(Ⅰ、Ⅱ),食品分离株以ST121(CC121,占30.43%)、ST87(CC87,占21.74%)和ST8(CC8,占17.39%)为优势型别;病例株则以ST37(CC37,占27.27%)为主。毒力基因聚类将菌株划分为Ⅰ和Ⅱ两大类,所有菌株均携带LIPI-1和LIPI-2毒力岛,仅聚类Ⅱ中的所有菌株携LIPI-3毒力岛,显示出较高致病潜力。耐药基因检测表明,多数菌株携带1-4个耐药基因,且以谱系Ⅱ为主。基于全基因组单核苷酸多态性的进化分析进一步将菌株划分为3个遗传分支,呈现明显的谱系聚集特征,但未发现菌株来源(食品/病人)与遗传聚类间的明确关联。结论温州地区单增李斯特菌流行株具有丰富的毒力多样性及广泛的多药耐药潜力,其传播路径复杂,致病风险可能受多种进化因素共同调控。