基于全基因组关联分析挖掘水稻抗旱相关基因OA
Mining of Drought-resistance Related Genes in Rice Based on Genome-wide Association Study
[目的]分析与水稻叶枯萎度相关的数量性状位点(QTLs),为筛选水稻耐旱候选基因提供参考.[方法]以300份水稻种质资源为材料,在干旱胁迫下调查叶卷曲指数(leaf rolling index,LRI)和叶枯萎度(leaf wilt degree,LWD),利用全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)定位耐旱相关数量性状位点.[结果]叶卷曲指数和叶枯萎度表型呈正态分布,通过全基因组关联分析定位到4个与叶枯萎度相关的数量性状位点(quantitative trait loci,QTLs),其中,qLWD4-1在2个调查时期均能被检测到.根据单倍型分析和基因功能注释信息,在qLWD4-1定位区间内筛选到4个耐旱候选基因(LOC_Os04g54360、LOC_Os04g54474、LOC_Os04g54560和LOC_Os04g54570).[结论]在2个调查时期内均检测到一个稳定表达、与叶枯萎度相关的QTL(qLWD4-1),并在该区间内鉴定到4个耐旱候选基因.
[Objective]Analysis of quantitative trait loci(QTLs)associated with rice leaf wilt degree,providing a reference for screening drought-tolerance candidate genes in rice.[Method]Using a panel of 300 rice germplasm resources,the leaf rolling index(LRI)and leaf wilt degree(LWD)were investigated under drought stress.Genome-wide association study(GWAS)was employed to map drought tolerance-related quantitative trait loci(QTLs).[Result]Phenotypic data for LRI and LWD followed a normal distribution.Four QTLs associated with LWD were identified via GWAS.Among these,qLWD4-1 was consistently detected across both investigation periods.Based on haplotype analysis and gene function annotation,four candidate genes for drought tolerance(LOC_Os04g54360,LOC_Os04g54474,LOC_Os04g54560,and LOC_Os04g54570)were screened within the qLWD4-1 locus region.[Conclusion]This study identified a stably expressed QTL(qLWD4-1)associated with leaf wilt degree across two investigation periods via GWAS,and four drought-resistant candidate genes were determined within this locus.
宋子慧;薛丽;王森;孙建昌;韩冰;崔迪;韩龙植;赵正武;马小定
重庆师范大学生命科学学院 重庆市特色作物资源工程技术研究中心,重庆 401331||中国农业科学院国家南繁研究院(三亚),三亚 572000||中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081||长江大学农学院,荆州 434025中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081||四川农业大学西南作物基因资源发掘与利用国家重点实验室,成都 611130宁夏农林科学院农作物研究所,银川 750002中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081重庆师范大学生命科学学院 重庆市特色作物资源工程技术研究中心,重庆 401331中国农业科学院国家南繁研究院(三亚),三亚 572000||中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081
水稻抗旱性全基因组关联分析主成分分析数量性状位点
ricedrought resistancegenome-wide association studyprincipal component analysisquantitative trait loci
《生物技术通报》 2026 (8)
97-105,9
三亚中国农业科学院国家南繁研究院南繁专项(YBXM2570)
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