野鲮亚科四种养殖鱼类的遗传多样性和遗传结构特征OA
【目的】评估野鲮亚科四种养殖鱼类的种质遗传现状。【方法】采集3个野生群体(广东鲮、广西鲮和桂孟加拉鲮)和2个养殖群体(麦瑞加拉鲮和露斯塔野鲮)共53尾鳍条样本,提取基因组DNA后采用液相芯片进行检测。对原始数据进行严格质控和过滤,筛选出高质量SNP位点,用于遗传多样性和群体结构分析,包括遗传分化系数(F_(st))和核苷酸多样性(π)等指标的评估。【结果】共获得331750080个Clean Reads,检测到28693个SNPs位点。4种鲮的核苷酸多样性(π)范围为0.00002075~0.00000354,群体间遗传分化系数(F_(st))变化范围为0.018~0.554,显示各物种间存在显著遗传分化。系统发育树,PCA分析和Structure聚类分析显示4个野鲮亚科鱼类群体聚为2支,鲮、露斯塔野鲮和麦瑞加拉鲮聚为一支,桂孟加拉鲮单独为一支。【结论】广东和广西鲮野生群体遗传多样性较低,且群体间遗传分化显著。应加强鲮种质资源的保护和管理,以确保鲮野生种质资源的可持续利用。
俞巧珍;何锐聪;何柔梦;陈语轩;李立森;邱军强;姜志勇;徐晓雁;李家乐
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农业科技
野鲮亚科单核苷酸多态性(SNP)群体结构遗传多样性
《水产学报》 2026 (8)
P.28-37,10
国家现代农业产业技术体系专项(CARS-45-04)。
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