大鼠视神经损伤后视网膜差异表达的神经再生相关基因OA

目的:探寻大鼠视神经损伤后差异表达基因(DEGs)中与神经再生相关的关键基因。方法:对新生组、成年正常组、假手术组、视神经压榨伤后1、7 d和14 d 6组大鼠的视网膜进行基因芯片检测,获得DEGs,并用RTqPCR验证,然后对DEGs进行聚类、基因本体和京都基因和基因组百科全书分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,确定中心基因。结果:共获得159个DEGs,分为2类6聚簇,主要富集在氧和二氧化碳转运、创伤治愈、神经元突起再生、细胞外基质构建、免疫和炎症反应、细胞骨架和纤维组装、轴突再生等过程,经PPI网络分析后筛选出值得关注的5个中心基因(Fn1、Fmod、Timp1、Lgals3和Hmox1)和4条互作通路(Hmox1/Stat3/Jun-Lgals3-Fn1-Vcan;Hmox1/Stat3/Jun-Lgals3-S100a11-Tspo;Fos-Slc17a6/Calb2-Nefm以及Hmox1/Fos-Adm)。结论:应用生物信息学方法筛选到视神经压榨伤后视网膜中调控神经再生的若干关键基因,为后续研究视神经内在再生机制提供新思路和新策略。