全基因组关联荟萃分析鉴定影响鸭体重性状的基因OA

【目的】本研究旨在鉴定调控鸭体重性状的候选基因,为鸭体重精准育种提供分子标记和理论依据。【方法】基于3个以北京鸭为亲本的分离群体:北京鸭×绿头野鸭F2分离群体(P×M,n=923)、北京鸭×连城白鸭梯度血缘分离群体(P×L,n=646)以及北京鸭×柯尔鸭F2分离群体(P×C,n=373),开展鸭体重性状的全基因组关联荟萃分析(genome-wide association Meta-analysis,GWAMA)及单群体的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),结合候选区间内基因在6周龄北京鸭、连城白鸭肌肉和脂肪组织中的表达差异,鉴定调控鸭体重性状的候选基因。【结果】比较3个杂交分离群体鸭体重性状发现,北京鸭×柯尔鸭F2分离群体中鸭平均体重显著低于其他两个群体(P<0.05)。进一步通过GWAS发现,在北京鸭×连城白鸭梯度血缘分离群体中,于34号染色体上鉴定到与鸭体重相关的候选基因ITGA7,其候选区间内最显著关联位点Chr34:g.2869073 A>G变异使鸭体重提升4.61%;在北京鸭×柯尔鸭F2分离群体中,于1号染色体上鉴定到与鸭体重相关的候选基因ITSN1,其候选区间内最显著关联位点Chr1:g.110861143 T>C变异使鸭体重提升3.43%。对3个群体进行体重性状GWAMA,在2号染色体上鉴定到与鸭体重相关的候选基因CSMD3,其候选区间内最显著关联位点Chr2:g.16831074 C>T变异使鸭体重提升3.41%。【结论】本研究分别从北京鸭×连城白鸭梯度血缘群体、北京鸭×柯尔鸭F2分离群体及3个群体荟萃分析中鉴定出3个调控鸭体重性状的候选基因:ITGA7、ITSN1、CSMD3。本研究结果为鸭体重性状的精准选育提供了新的分子靶点。