基于网络药理学和分子对接探讨建中散治疗胃溃疡的活性成分及潜在机制OA

目的:本研究旨在通过网络药理学、分子对接和生物信息学分析,探讨建中散治疗胃溃疡的潜在作用靶点和作用机制。方法:从2020版《中华人民共和国药典》中收集建中散处方中要求含量测定的活性成分,从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及文献中收集相应的作用靶点,并对其进行鉴定。利用毒性与基因比较数据库(CTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、疾病基因网络数据库(DisGeNET)、药物数据库(Drugbank)和治疗靶点数据库(TTD)挖掘胃溃疡的潜在治疗靶点。用Cytoscape 3.8.2软件构建并显示常见靶标的蛋白质–蛋白质相互作用网络。进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,以分析蛋白质–蛋白质相互作用网络中核心靶标的功能。利用Discovery Studio软件进行分子对接,验证建中散主要组分与核心靶标的相关性。结果:共得到15个活性成分和133个对应的靶点,其中与胃溃疡相关的靶点共有69个。从蛋白质–蛋白质相互作用网络中筛选了12个枢纽基因,包括肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、半胱天冬酶3(caspase 3,CASP3)、雌激素受体1(estrogen receptor 1,ESR1)、前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)、基质金属蛋白酶9(matrix metalloprotein 9,MMP9)、信号传导及转录激活蛋白(signal transducer and activator of transcription,STAT)3、白细胞介素–1β(interleukin-1 beta,IL-1B)、糖原合成酶激酶3β(glycogen synthase kinase 3 beta,GSK3β)、热休克蛋白90α家族A类成员1(heat shock protein 90 alpha family class A member 1,HSP90AA1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator activated receptor gamma,PPARG)、Jun原癌基因(Jun proto-oncogene,JUN)、周期蛋白依赖性激酶2(cyclin-dependent kinases 2,CDK2)。分子对接结果显示,TNF、PTGS2、GSK3β、PPARG和CDK2是这些核心靶点中的关键靶点。这些靶点主要与对激素的反应、对无机物的反应、神经元凋亡过程的调控、凋亡信号通路的调节和程序性细胞死亡的正向调控有关。KEGG信号通路富集分析表明,这些靶点与癌症的发病途径、脂质与动脉粥样硬化、白细胞介素–17(Interleukin-17,IL-17)信号通路、非酒精性脂肪肝、沙门氏菌感染、致病性大肠杆菌感染、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(advanced glycation end product,AGE)–晚期糖基化终末产物受体(advanced glycation end product receptor,RAGE)信号通路、TNF信号通路相关。分子对接结果表明,建中散中多种有效成分与TNF、PTGS2、PPARG和CDK2等具有良好的结合亲和力。结论:建中散可能通过多组分、多靶点和多途径发挥抗炎和抗氧化应激作用以治疗胃溃疡。