基于线粒体COI和Cyt b基因研究青藏高原喜马拉雅旱獭种群遗传多样性OA
目的分析青藏高原喜马拉雅旱獭种群动态和遗传结构,解决当前鼠疫监测和溯源过程中残缺标本的鉴定瓶颈问题,为鼠疫防控提供科学依据。方法采集喜马拉雅旱獭组织样本,提取基因组DNA,扩增线粒体COI和Cyt b基因片段,并进行测序分析。结果COI和Cyt b基因序列的碱基转换值均显著高于颠换值,COI基因序列的种内遗传距离范围为0.0001~0.012,Cyt b基因序列的种内遗传距离范围则为0.001~0.03。基于Cyt b基因构建的NJ系统聚类树显示,喜马拉雅旱獭聚为一个主要分支,表明喜马拉雅旱獭具有独立的母系起源。结论基于COI基因的DNA条形码技术非常适用于鼠疫自然疫源地宿主动物鉴定和疫情处置现场传染源的快速识别及追溯诊断研究。
张爱萍;李玲雯;谷昕玥;张鹏辉;王文龙;杨春辉;马林德;刘中凯;史艳文;马英
青海省地方病预防控制所,西宁810021 国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(青海省地方病预防控制所),西宁810021青海省地方病预防控制所,西宁810021 国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(青海省地方病预防控制所),西宁810021青海省地方病预防控制所,西宁810021 国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(青海省地方病预防控制所),西宁810021青海省地方病预防控制所,西宁810021 国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(青海省地方病预防控制所),西宁810021青海省地方病预防控制所,西宁810021 国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(青海省地方病预防控制所),西宁810021青海省地方病预防控制所,西宁810021 国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(青海省地方病预防控制所),西宁810021青海省地方病预防控制所,西宁810021 国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(青海省地方病预防控制所),西宁810021青海省地方病预防控制所,西宁810021 国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(青海省地方病预防控制所),西宁810021青海省地方病预防控制所,西宁810021 国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(青海省地方病预防控制所),西宁810021青海省地方病预防控制所,西宁810021 国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(青海省地方病预防控制所),西宁810021
医药卫生
COICyt b喜马拉雅旱獭遗传多样性青藏高原
《中国人兽共患病学报》 2026 (7)
P.675-680,6
国家自然基金项目(No.82460660)青海省重点研发与转化计划(No.2025-QY-208)。
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