宣和猪PHKG1基因多态性及其对胴体和肉质性状的影响OA

为探究磷酸化酶激酶γ1(PHKG1)基因多态性对宣和猪胴体及肉质性状的影响,以110头宣和猪为研究对象,采用Sanger测序技术检测PHKG1基因单核苷酸多态性(SNP)位点,结合最小二乘模型分析各位点及单倍型组合与胴体、肉质性状的关联效应。结果表明,宣和猪PHKG1基因共存在5个同义SNP位点,分别位于外显子3(rs319153825和rs328686594)和外显子10(rs322352666、rs341765073和rs709202338)区域,所有位点均符合哈迪-温伯格平衡。各位点优势基因型分别为AG(0.5636)、CC(0.8364)、TT(0.5909)、CC(0.8364)、CC(0.8364),优势等位基因为A(0.5364)、C(0.9182)、T(0.7909)、C(0.9182)、C(0.9182)。rs319153825与rs322352666位点为中度多态[多态信息含量(PIC)分别为0.3737、0.2760],遗传多样性较高[杂合度(H)分别为0.4974、0.3307];rs328686594、rs341765073、rs709202338位点均为低度多态(PIC=0.1390),遗传多样性较低(H=0.1502)。关联分析表明,rs319153825位点与后腿比例和屠宰率间存在显著关联,rs322352666位点与熟肉率间存在极显著关联,rs328686594、rs341765073和rs709202338位点与屠宰率和肌内脂肪含量间均存在显著关联;单倍型组合ACTCC/ACTCC与胴体直长、眼肌面积、屠宰率、瘦肉率、肉色评分、大理石纹评分、熟肉率和肌内脂肪含量之间存在显著或极显著关联;含有ACTCC单倍型个体的胴体与肉质指标均处于较高水平,表现出明显的增效效应。综上,PHKG1基因多态性对宣和猪胴体与肉质性状存在显著调控作用,可作为关键候选基因与分子遗传标记,为宣和猪分子标记辅助育种、遗传改良提供理论依据。