白辣椒青熟期果色主效QTL定位及候选基因筛选OA

白辣椒是华南众多名特优美食必需的调味品和佐餐品,青熟期果色是其重要的外观品质性状,直接影响商品价值和消费选择。本研究以青熟期白色朝天椒(ZW13,♀)和绿色朝天椒(ZG14-1,♂)自交系为亲本,杂交构建F2分离群体,对白辣椒果色进行遗传分析。利用GradedPool-seq方法对F2群体3个果色亚群混池重测序,在初定位区间开发Indel分子标记;采用完备区间作图法(ICIM)构建局部遗传图谱,结合色差仪果色鉴定,完成白辣椒青熟期果色主效QTL定位及候选基因筛选。结果显示:在426株F2群体中绿色∶黄绿色∶白色植株分离比为12∶3∶1,表明白辣椒青熟期果色主要由2对独立遗传的基因共同控制,绿色基因对黄色基因有显性上位作用。通过GradedPool-seq和遗传图谱共定位在1号和10号染色体上,获得2个与白辣椒青熟期果色相关的主效QTL,其中1号染色体上qFC01位点位于标记MU0106和MM0102之间约0.13 Mb范围内,表型贡献率和LOD值分别为10.09%和4.40;10号染色体上qFC10位点位于标记MM1028和MM1035之间约0.93 Mb范围内,表型贡献率和LOD值最高,分别为45.79%和25.04。10号染色体区间内6个基因在双亲编码区存在非同义突变,通过在双亲和F1青熟期果实中进行qRT-PCR表达模式验证,结合生物信息学分析,推测Capana10g000333(CaGLK2)为影响白辣椒青熟期果色的关键候选基因。本研究为深入解析白辣椒果色分子遗传机制奠定基础,也为选育高品质白辣椒新品种提供分子标记。