咖啡患根腐病与健康植株根际土壤细菌群落结构差异分析OA

作为全世界重要的饮料作物之一,咖啡在热带农业生产体系中占有显著地位。但由于近年来大量采用集中连片化的种植方式,咖啡根腐病的发生态势逐年加剧,严重影响咖啡产业的发展。为探讨根腐病咖啡植株与健康植株根际土壤细菌群落结构之间的差异,以及微生物群落变化对病害发生的影响,本研究从云南省保山市隆阳区潞江镇咖啡种植基地随机采集患病和健康咖啡植株的根际土壤样品,通过高通量测序技术,对细菌16S rRNA基因V3~V4区进行扩增和测序,分析α多样性、β多样性和群落组成,应用LEfSe方法分析不同组间差异显著的生物标志物,并进行细菌的功能预测。结果表明:根腐病植株根际土壤细菌α多样性与健康植株无显著差异,β多样性存在明显差异。门水平上,优势菌门包括变形菌门(Pseudomonadota)、放线菌门(Actinomycetota)等,但患病植株中厚壁菌门(Bacillota)的相对丰度增加,而变形菌门和放线菌门的丰度在健康植株中较高;属水平上,患病植株根际土壤中新芽孢杆菌属(Neobacillus)显著富集,健康植株中节杆菌属(Pseudarthrobacter)等有益菌群占优势。两组样品细菌群落功能组成存在部分显著差异,但核心功能保持一致,表明病害的发生可能更多是受到群落结构变化的影响,而不是核心功能改变的影响。咖啡根腐病发生与根际土壤细菌群落结构的变化有较大关系,潜在病原菌富集,有益菌群下降可能加速病程的发生。