基于全基因组重测序评估扬州鹅高产系(全白羽系)选育效果OA

旨在研究扬州鹅高产系(全白羽系)的遗传多样性和亲缘关系,以评估该专门化品系在基因组上的选育效果。本研究中,扬州鹅育种中心的高产系(全白羽系)采取纯系选育的方式,随机从该专门化选育家系中选取48只10周龄健康公鹅,采集静脉血提基因组DNA,并进行10×全基因组重测序,利用生物信息学程序对群体基因组进行遗传多样性和群体遗传结构分析与评价。经质控共筛选得到14398912个单核苷酸多态性位点。群体遗传多样性分析结果显示,群体平均观测杂合度为0.223,平均期望杂合度为0.253,群体近交系数均值为0.128,平均多态信息含量为0.207。采样群体共检测到259个连续纯合片段(ROHs),基于ROH值计算得出的近交系数为0.008,近交程度较低。IBS遗传距离矩阵与亲缘关系矩阵的结果趋势相似。主成分分析与聚类分析结果显示,采样群体呈均匀的聚集状态。总体而言,本研究抽样的扬州鹅高产系(全白羽系)群体,在高强度的人工定向选育下,仍保留了一定的遗传多样性,选育后的遗传多样性水平良好。