两株O型Ind-2001谱系口蹄疫病毒的全基因组测定与遗传演化分析OA
为了了解我国牛携带口蹄疫病毒(FMDV)的情况,从边境和内陆某中小规模牛场随机采集食道-咽喉部分泌物(OP液)46份,应用RT-PCR扩增FMDV VP1基因序列,进行了测序和遗传演化分析,同时对确定为FMDV阳性的样品进行了全序列测定和抗原位点的变异分析。结果显示,从采集的46份OP液样品中,检出FMDV核酸阳性样品7份,其中边境地区某牛场5份、内地某牛场2份,均属O/ME-SA/Ind-2001e谱系毒株;VP1基因序列分析发现2个毒株的核苷酸相似性为95.6%,推测它们可能不是同一传播链演化而来的毒株。其中边境牛场样品O/240907株与参考毒株O/XJ/CHA/2017的VP1基因核苷酸相似性为95.46%,与越南2024年流行株O/VTN/24FS55/2024核苷酸高度相似(达99.1%),结合牛场地理位置,推测与境外毒株输入有关;境内牛场样品O/240408株与O/XJ/CHA/2017株的VP1基因核苷酸相似性为94.65%,与蒙古国2021年流行毒株相似性最高为98.1%,推测O/240408毒株并非新近传入,可能由先前已知的本地流行株经境内持续循环传播演化而来。O/240907株、O/240408株全基因组序列长度分别为8182 nt、8187 nt,与O/XJ/CHA/2017株比较结构蛋白氨基酸序列发现,2株病毒在VP1、VP2及VP3蛋白的抗原位点及其邻近区域发生了15处氨基酸突变,表明我国O/ME-SA/Ind-2001e谱系FMDV在田间传播过程中正经历复杂的抗原演化,需持续进行动态监测,有效防控口蹄疫的暴发。本研究为O型FMDV的遗传演变分析、疫源追踪、风险分析和预警预报的开展及防控策略优化等提供了重要依据。
刘茹菊;李平花;秦天达;刘玉;苏文俊;马雪青;欧阳一凡;卢曾军;王桂荣;孙普
甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州730070 中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室国家口蹄疫参考实验室,甘肃兰州730046甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州730070 中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室国家口蹄疫参考实验室,甘肃兰州730046甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州730070天祝县动物疫病预防控制中心,甘肃天祝733200天祝县动物疫病预防控制中心,甘肃天祝733200甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州730070 中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室国家口蹄疫参考实验室,甘肃兰州730046中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室国家口蹄疫参考实验室,甘肃兰州730046中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室国家口蹄疫参考实验室,甘肃兰州730046甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州730070甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州730070 中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室国家口蹄疫参考实验室,甘肃兰州730046
农业科技
口蹄疫病毒O/ME-SA/Ind-2001e谱系全基因组遗传演化
《中国兽医科学》 2026 (7)
P.928-935,8
国家重点研发计划项目(2023YFD1802501)甘肃省科技计划项目(25CXNA034,25CXNA045)。
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