高粱FAR1/FHY3基因家族全基因组鉴定及其在籽粒发育中的表达分析OA
FAR1/FHY3转录因子在植物光响应、逆境应答及生长发育中发挥重要作用。为系统鉴定高粱(Sorghum bicolor L.)FAR1/FHY3基因,对该基因家族进行了全基因组鉴定和表达特征分析。采用生物信息学方法对FAR1/FHY3的系统发育、基因结构、染色体定位、启动子顺式元件及组织特异性表达进行分析,并通过籽粒灌浆期转录组数据和RT-qPCR分析FAR1/FHY3基因的表达模式。结果表明:高粱中共鉴定到46个SbFAR1基因,定位到10条染色体上,系统发育分析将其划分为4个亚族;共线性分析表明高粱与水稻存在20对同源基因;启动子区存在与光响应和植物激素响应有关的顺式作用元件。组织表达分析显示,SbFAR1-12/5/36在叶中高表达,SbFAR1-36/20在成熟籽粒中高表达。两个品种转录组分析显示,SbFAR1基因在花后5 d和10 d籽粒中表达量较高。对转录组中9个高表达基因进行RT-qPCR验证,千三(QS)中SbFAR1-2/14/29/36/44表达量显著高于河农16(HN16)。SbFAR1-14/28/36/39/5/2/17/15在籽粒灌浆期高表达,可能参与调控高粱籽粒发育过程。本研究解析了高粱FAR1/FHY3基因家族的进化特征与表达模式,为该家族基因功能研究奠定基础。
项晓冬;孙聪慧;王宇轩;胡嘉琦;赵玲琪;高玉坤;常金华
内蒙古师范大学生命科学与技术学院,内蒙古呼和浩特010022 内蒙古自治区高等学校蒙古高原生物多样性保护与可持续利用重点实验室,内蒙古呼和浩特010022内蒙古师范大学生命科学与技术学院,内蒙古呼和浩特010022内蒙古师范大学生命科学与技术学院,内蒙古呼和浩特010022内蒙古师范大学生命科学与技术学院,内蒙古呼和浩特010022内蒙古师范大学生命科学与技术学院,内蒙古呼和浩特010022河北农业大学农学院,河北保定071001河北农业大学农学院,河北保定071001
农业科技
高粱FAR1/FHY3基因家族全基因组鉴定籽粒发育转录组测序
《河北农业大学学报》 2026 (3)
P.10-19,10
河北省农业科技成果转化资金项目(2025JNZ-S16)内蒙古自然科学基金项目(2025QN03089)内蒙古师范大学引进高层次人才科研启动项目(2025YJRC082).
评论