基于转录组SNP/InDel解析多鳞白甲鱼黄色表型与生长迟缓关联因素OA

多鳞白甲鱼(Onychostoma macrolepis)体色可随光照条件发生可逆变化:避光时呈黑褐色,经光照后转变为黄色,再次避光可恢复黑褐色。但部分个体呈现稳定黄色表型,并表现出生长迟缓的现象。目前,这一“稳定黄色表型-生长迟缓”关联性状的分子调控机制尚不明确。本研究以黑褐色与黄色表型多鳞白甲鱼的皮肤组织为样本,基于转录组测序(RNA-seq)数据,通过差异表达基因(DEGs)分析、功能富集分析及变异位点检测,鉴定与表型差异相关的关键基因及遗传变异。结果显示,黄色个体中肌节与肌原纤维组装相关基因表达显著下调;线粒体氧化磷酸化及三羧酸循环相关通路的基因表达受到显著抑制。单核苷酸多态性(SNP)及插入/缺失(InDel)分析显示:驱动蛋白家族成员21B(KIF21B)基因存在错义突变;乙酰辅酶A合成酶2(ACSS2)基因发生移码突变,导致蛋白翻译提前终止,进而造成底物结合口袋结构部分缺失。细胞运输与ATP供给相关基因的突变,或为黄色多鳞白甲鱼体色稳定表型与生长迟缓共存的关键因素。该研究可为多鳞白甲鱼种质资源保护与遗传改良提供可能靶点。