基于重测序的籽鹅产蛋量相关SNP研究OA
研究旨在挖掘籽鹅产蛋量相关单核苷酸多态性(SNP)位点,试验对96只300日龄产蛋籽鹅进行全基因组重测序,结合全基因组关联分析(GWAS,覆盖所有试验个体)及选择消除分析(Fst,依据产蛋记录划分高产组与低产组,每组30只),筛选产蛋量相关SNP位点及候选基因。结果显示:全基因组重测序共鉴定出14224082.00个SNP位点;选择消除分析获得的候选基因经基因本体(GO)富集分析,显著富集于细胞表面受体信号通路、激素分泌的正调控、肽激素分泌和白细胞趋化的正调控等4个生物学过程,关键候选基因为内皮素3基因(EDN3);GWAS筛选得到1个接近建议显著水平的SNP位点(Chr3:1887704),该位点定位于LOC106044706基因内含子区,次要等位基因频率为0.26,且主要分布于低产组。研究表明,试验基于重测序数据鉴定出产蛋量候选基因EDN3,定位到显著关联位点Chr3:1887704。
张震;张梦幻;葛爱有;陈保君;韩志强;佟玲;陈国福
黑龙江省农垦科学院,黑龙江哈尔滨150038黑龙江省农垦科学院,黑龙江哈尔滨150038黑龙江省农垦科学院,黑龙江哈尔滨150038黑龙江省农垦科学院,黑龙江哈尔滨150038黑龙江省农垦科学院,黑龙江哈尔滨150038黑龙江省农垦科学院,黑龙江哈尔滨150038黑龙江省农垦科学院,黑龙江哈尔滨150038
农业科技
籽鹅重测序产蛋量单核苷酸多态性候选基因
《现代畜牧兽医》 2026 (6)
P.1-5,5
黑龙江省鹅产业技术协同推广体系项目北大荒农垦集团有限公司重点研发计划(2026JHZD-04)北大荒集团种业创新发展项目(2022ZY0102-02-04)。
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