樟树MYC转录因子的全基因组鉴定与表达分析OA

【目的】MYC转录因子是茉莉酸(JA)信号通路的核心调节因子,在调控植物生长发育和次生代谢过程中发挥重要作用。鉴定和分析樟树中的MYC转录因子,为研究萜类等次生代谢产物合成以及生长发育提供依据。【方法】采用生物信息学方法,对CcMYC家族进行全基因组鉴定,分析其染色体定位、理化性质、亚细胞定位、家族进化关系、基因结构、启动子和PPI网络,并结合实时荧光定量PCR分析CcMYC基因家族在樟树6种化学型中的表达模式。【结果】CcMYC1-CcMYC12不均匀地分布在10条染色体上。CcMYC家族编码蛋白含629个氨基酸,平均分子质量69.64 kD,理论等电点5.15-6.69,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。蛋白的亚细胞定位结果显示,CcMYC12主要定位于细胞核。系统进化分析结果表明,CcMYC基因分属于不同的3个组;种间共线性分析表明,CcMYC基因存在片段重复事件,CcMYC1、CcMYC4和CcMYC5在拟南芥、水稻和毛果杨中均存在共线基因;启动子顺式作用元件分析表明,CcMYC基因可能受到光照、多种植物激素以及防御与胁迫的诱导。蛋白互作分析揭示,CcMYC3、CcMYC7、CcMYC8、CcMYC11可能在调控樟树类黄酮、萜类等次生代谢物质合成积累中发挥重要作用。【结论】从樟树基因组中共鉴定出12个MYC家族成员,CcMYC1、CcMYC8在右旋龙脑型和柠檬醛型中高表达,CcMYC11、CcMYC12在芳樟醇型中高表达,它们可能在不同化学型樟树精油主要成分合成与萜类等次生代谢积累中发挥重要作用。