中国西南地区4个山羊品种产仔数性状全基因组关联分析OA
【目的】产仔数是山羊最重要的经济性状之一。挖掘与山羊产仔数性状显著关联的遗传变异位点及相关候选基因。【方法】以酉州乌羊、大足黑山羊、川中黑山羊、黔北麻羊4个西南地区山羊品种为研究对象,收集保种场历史产羔记录,采集高产母羊60个和低产母羊54个血液样品,进行平均测序深度为27.10×的全基因组重测序。利用群体遗传分化指数(Fst)和全基因组关联分析(GWAS)的方法挖掘与目的性状强关联位点,通过基因注释、GO和KEGG富集分析、单倍型分析,确定最有可能的候选基因。【结果】共鉴定到65个候选SNP位点,分布在2号、4号和X染色体上的4个Fst显著选择区域内,预测5个与产仔数性状有关的候选基因,其中COL4A5和COL4A6基因显著富集到ECM-受体相互作用、PI3K-Akt等信号通路,注释到COL4A6基因和ETV1基因上的显著变异位点各自构成一个单倍型块,且Hape1均与其他单倍型的产仔数差异极显著(P<0.01)。【结论】检测到多个与产仔数性状显著关联的SNP位点,筛选出COL4A5、COL4A6、ETV1、SP3和PLS3等基因可能是影响山羊产仔数性状的候选基因,为西南地区山羊高繁殖力遗传改良和品种选育提供了新的视角。
蒋婧;吕士鹏;陈浩林;熊婷;孙晓燕;李杰;陈灿灿;王高富;任航行
重庆市畜牧科学院,重庆402460 重庆市山羊工程技术研究中心,重庆402460重庆市畜牧科学院,重庆402460 重庆市山羊工程技术研究中心,重庆402460贵州省农业科学院畜牧兽医研究所,贵阳550005重庆市大足区动物疫病预防控制中心,重庆402360重庆市畜牧科学院,重庆402460 重庆市山羊工程技术研究中心,重庆402460重庆市畜牧科学院,重庆402460 重庆市山羊工程技术研究中心,重庆402460重庆市畜牧科学院,重庆402460 重庆市山羊工程技术研究中心,重庆402460重庆市畜牧科学院,重庆402460 重庆市山羊工程技术研究中心,重庆402460重庆市畜牧科学院,重庆402460 重庆市山羊工程技术研究中心,重庆402460
农业科技
全基因组关联分析产仔数性状山羊群体遗传分化指数全基因组重测序
《生物技术通报》 2026 (7)
P.341-350,10
重庆市科研机构绩效激励引导专项项目(23507J)重庆市自然科学基金项目(CSTB2022NSCQ-MSX1472)重庆市畜牧科学院市级财政科研项目(22544C)。
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