基于网络药理学和分子对接技术探讨人参皂苷Rb1治疗高脂血症的作用机制OA

目的:采用网络药理学及分子对接技术探讨人参皂苷Rb1治疗高脂血症的作用机制。方法:在PubChem、PharmMapper、UniProt数据库中获得人参皂苷Rb1的分子结构及潜在靶点基因,在GeneCards、DisGeNET数据库中获得高脂血症相关作用靶点,应用venny2.1.0获得人参皂苷Rb1与高脂血症的共同靶点,并将共同靶点导入STRING数据库构建蛋白相互作用网络。用DAVID数据库对共同靶点进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。CytoScape 3.8.2软件构建人参皂苷Rb1治疗高脂血症的药物-靶点-通路网络,并筛选出核心靶点,利用PyMOL及AutoDock Vina软件,对人参皂苷Rb1和重要靶点蛋白进行分子对接验证。结果:筛选得到人参皂苷Rb1相关靶点940个,高脂血症相关靶点2915个,两者共同靶点99个,MCODE算法筛选出Hub基因31个。富集分析获得GO富集注释条目201个,包括112个生物过程(BP)、36种细胞组分(CC)和53种分子功能(MF)。KEGG分析得到38条信号通路,显示人参皂苷Rb1可作用于碳代谢、淀粉和蔗糖代谢等多种代谢途径以及过PPAR、HIF-1等信号通路,并对酒精性肝病等显示出潜在的治疗优势。分子对接显示人参皂苷Rb1与关键靶点蛋白呈现较好的结合力,结合能均小于-5 kcal/mol。结论:人参皂苷Rb1治疗高脂血症具有多靶点、多途径、多通路等特点,可通过PGK1、MDH2、IDH1和IDH2等关键代谢酶和ESR1调节因子构成的网络发挥作用,参与机体糖酵解、TCA循环、细胞氧化还原反应、脂质合成/分解等多个核心代谢通路和激素信号通路,影响脂质合成、脂质分解以及脂质转运。人参皂苷Rb1具有良好的药效活性,有望成为治疗高脂血症的潜在药物。