原发性干燥综合征免疫原性细胞死亡关键基因筛选与验证OA

目的利用多组学数据,系统筛选并验证在原发性干燥综合征(pSS)中发挥重要作用的关键免疫原性细胞死亡(ICD)基因。方法从基因表达数据库(GEO)中获取pSS患者(131例)与健康对照(29例)的基因表达谱(GSE66795),将其与已知的ICD核心基因集及pSS相关靶点取交集,筛选候选基因。运用CIBERSORT算法分析样本的免疫细胞浸润特征;结合分选CD8^(+)T细胞亚群的转录组数据(GSE93683)进行表达验证。最后,收集10例pSS患者及4例健康对照的唇腺组织和外周血样本,通过RT-qPCR对关键基因进行实验验证。结果共筛选出7个ICD差异表达基因与pSS交集基因[胱天蛋白酶(CASP1)、叉头框蛋白P3(FOXP3)、干扰素γ(IFNG)、髓样分化因子88(MYD88)、Toll样受体7(TLR7)、DExD/H盒螺旋酶58(DDX58)和干扰素诱导解旋酶C结构域1(IFIH1)]。免疫浸润分析显示,pSS唇腺组织中初始B细胞与树突状细胞比例显著升高,静息NK细胞及M0巨噬细胞比例降低(P<0.05)。CD8^(+)T细胞亚群转录组数据表明,IFIH1在中央记忆型CD8^(+)T细胞中表达显著升高(P<0.05)。RT-qPCR实验验证显示,DDX58、IFIH1、CASP1在pSS外周血白细胞及唇腺组织中表达均上调(均P<0.05),IFNG在外周血中表达升高而在唇腺中表达降低(P<0.05)。结论本研究通过生物信息学与实验验证相结合的方法,筛选并证实了DDX58、IFIH1、CASP1、IFNG是pSS中关键的ICD相关基因,为深入理解pSS的免疫病理机制提供了新的候选靶点。