石蛏属线粒体基因组及其应用OA
石蛏属(Lithophaga)物种在珊瑚礁生态系中有着重要的生态价值,但已公开的线粒体基因组信息极少。本研究新测石蛏属光石蛏(L.teres)和金石蛏(L.zitteliana)线粒体基因组,并研究其在系统演化及群体遗传学方面的应用。光石蛏和金石蛏线粒体基因组均为双链环状结构,分别为35469 bp和38333 bp,均由2个r RNA、22个t RNA和13个蛋白编码基因(PCGs)组成。贻贝科(Mytilidae)物种系统发育结果显示,石蛏属为单系发生,与膜石蛏属(Leiosolenus)的短石蛏(Leiosolenus lischkei)亲缘关系较远(后者与沼蛤Limnoperna fortune紧密聚类),且PCGs种类(短石蛏缺少atp8)和功能基因排列顺序均存在较大差异,因此,支持将膜石蛏属(Leiosolenus)移出石蛏亚科(Lithophaginae)。此外,光石蛏和金石蛏线粒体PCGs选择压力分析结果表明,nad2基因的选择压力较小(K_(a)/K_(s)>0.5)且序列长度大(921 bp),能够提供充分的变异位点,适合作为群体遗传分析的分子标记。基于748 bp cox1基因和425 bp nad2基因片段分析我国南海3个光石蛏野生群体的遗传多样性,发现儋州群体遗传多样性较高,与其他群体之间遗传距离较远,分化明显;中性检验和错配分布分析表明,我国南海3个光石蛏群体近期均存在种群扩张。
马晓杰;左晨霞;霍永伟;朱懿;张翼飞;秦潇宇;张振
中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室,山东省海洋生物多样性与资源可持续利用重点实验室,山东青岛266071 中国科学院大学,北京100049中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室,山东省海洋生物多样性与资源可持续利用重点实验室,山东青岛266071河北省自然资源利用规划院,河北石家庄050051中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室,山东省海洋生物多样性与资源可持续利用重点实验室,山东青岛266071 中国科学院大学,北京100049中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室,山东省海洋生物多样性与资源可持续利用重点实验室,山东青岛266071 中国科学院大学,北京100049中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室,山东省海洋生物多样性与资源可持续利用重点实验室,山东青岛266071 中国科学院大学,北京100049中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室,山东省海洋生物多样性与资源可持续利用重点实验室,山东青岛266071 中国科学院大学,北京100049
生物科学
石蛏属线粒体基因组系统演化nad2基因种群遗传
《渔业科学进展》 2026 (4)
P.172-187,16
国家重点研发项目课题"大型设施化智慧渔场鱼贝生态养殖体系"(2022YFD2401204)资助。
评论