基于小鼠皮肤转录组测序探索银屑病发生发展的关键通路OA

目的运用皮肤高通量测序结合生物信息学分析筛选小鼠银屑病发展的关键通路。方法小鼠头颈后部皮肤局部涂抹咪喹莫特(IMQ),建立小鼠银屑病模型;对银屑病模型小鼠和对照小鼠皮肤进行转录组测序,结合生物信息学分析差异表达基因(DEGs),筛选关键通路;RT-PCR验证部分关键通路基因的表达差异。结果银屑病组小鼠皮损处表皮厚度增加,红斑、浸润、鳞屑评分及总评分均增高,提示小鼠银屑病模型构建成功。转录组测序共筛选出4752个DEGs,其中2276个显著上调,2476个显著下调;上调DEGs主要富集于细胞因子-细胞因子受体互作、中性粒细胞外诱捕网形成、NF-κB及IL-17信号通路等炎症相关通路,下调DEGs主要富集于过氧化物酶体、AMPK信号通路、PPAR信号通路以及各种脂质代谢通路等。进一步采用RT-PCR验证部分基因表达发现,与对照组相比,银屑病组小鼠皮肤组织中脂质代谢相关分子ELOVL4、SCD1、FAR2、FA2H、GSTM1 mRNA的表达下调,CXCL1、CXCL2、CXCL3、IL-1β、TNF-αmRNA表达上调,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论银屑病小鼠皮肤呈现免疫炎症过度激活、脂质与能量代谢广泛抑制的特征,炎症与脂质代谢通路形成相互作用的恶性循环;脂质代谢相关通路及关键基因可作为银屑病潜在的防治靶点。