缺氧对瓦氏黄颡鱼鳃组织细胞周期、糖代谢及热休克蛋白基因的调控OA

【目的】构建瓦氏黄颡鱼缺氧应激试验模型,明确鳃组织中相关基因对缺氧应激的响应机制,为深入探究其鳃组织缺氧适应性调控提供数据支撑,也为瓦氏黄颡鱼高适应性种群筛选提供理论依据。【方法】以1龄瓦氏黄颡鱼为研究对象,设3个处理组[对照组(C:溶解氧含量为6.50±0.10 mg/L)、缺氧组(H:溶解氧含量为0.75±0.10 mg/L,6 h)及恢复组(R:溶解氧含量为6.50±0.10 mg/L,6 h)],采集鳃组织样本提取RNA,通过转录组测序筛选出差异表达基因(DEGs)并进行GO功能注释分析及KEGG信号通路富集分析,采用实时荧光定量PCR进行验证。【结果】从C组、H组、R组共9个样本测序获得57.72 Gb的原始数据(Raw data),通过与参考基因组比对共注释到22116个基因,同时发现1824个新基因。从C组vs H组中共鉴定出554个DEGs,其中270个DEGs呈上调表达、284个DEGs呈下调表达;从C组vs R组中共鉴定出42个DEGs,其中12个DEGs呈上调表达、30个DEGs呈下调表达;从H组vs R组中共鉴定出993个DEGs,其中470个DEGs呈上调表达、523个DEGs呈下调表达。DEGs主要注释到细胞过程、单生物体过程、代谢过程、结合、催化活性、核酸结合转录因子活性、信号转导活性、细胞部分、细胞膜及细胞等GO功能条目;KEGG信号通路富集分析发现,DEGs主要富集在乳腺癌、癌症途径、基底细胞癌、细胞因子—细胞因子受体相互作用、化学致癌—DNA加合物、细胞色素P450对外源物质的代谢等信号通路上。实时荧光定量PCR检测结果显示,各组间部分DEGs的表达趋势与转录组测序结果基本一致。【结论】缺氧应激一定程度上抑制了瓦氏黄颡鱼的细胞增殖及其信号通路,导致三羧酸循环受抑制,但无氧呼吸被激活,鳃组织通过上调糖代谢基因表达以促使更多葡萄糖分解供能;糖酵解途径活化引起丙酮酸累积,此时丙酮酸激酶转录水平被抑制,糖异生途径被局部激活;热休克蛋白基因的表达变化可能是通过抑制自噬途径以减少能量消耗,进而对抗低氧胁迫。