基于网络药理学-分子对接-癌症基因组图谱(TCGA)的扶正散结方治疗非小细胞肺癌机制研究OA

【目的】预测中药复方扶正散结方治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。【方法】使用TCMSP、BATMAN-TCM、SwissADME等数据库及相关文献筛选得到扶正散结方的有效成分及作用靶点。使用OMIM、DrugBank、GeneCards、TTD等数据库获得NSCLC基因靶点。使用Venny在线绘制平台获得药物与疾病交集靶点。使用STRING数据库得到蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络信息。使用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-有效成分-靶点-疾病”网络图与PPI网络图。通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用SYBYL-X 2.1.1、Discovery Studio 2019与PYMOL 2.6软件对核心靶点与核心成分进行分子对接与可视化处理。最后使用癌症基因组图谱(TCGA)数据库进一步验证核心靶点在肺癌患者中的表达情况以及核心靶点在正常组与肺癌组中是否存在表达差异。【结果】(1)筛选出105个有效成分及282个有效成分作用靶点。中药有效成分与疾病共有185个交集靶点。(2)山柰酚、汉黄芩素、黄芩素、毒扁豆次碱、3,5,4’-三羟基-7,3’-二甲氧基黄酮等为扶正散结方治疗NSCLC的核心有效成分。AKT1、TP53、IL-6、TNF、IL-1β、EGFR、CASP3等靶点为扶正散结方治疗NSCLC的关键靶点。(3)GO分析得到403个相关条目,KEGG分析得到190条信号。KEGG分析显示癌症通路、PI3K/AKT信号通路、MAPK信号通路等是扶正散结方治疗NSCLC的关键通路。(4)分子对接表明黄芩素与ATK1,3,5,4’-三羟基-7,3’-二甲氧基黄酮与TNF、EGFR具有较好的结合性。(5)TCGA数据库差异表达分析显示,与正常肺组织相比,AKT1、IL-6、TNF、IL-1β在肺癌组织中为下调差异蛋白,而CASP3、EGFR、TP53为上调差异蛋白。【结论】扶正散结方可能通过黄芩素、3,5,4’-三羟基-7,3’-二甲氧基黄酮作用于AKT1、TP53、IL-6、TNF、IL-1β、EGFR、CASP3等靶点和癌症通路、PI3K/AKT信号通路等途径发挥抗NSCLC作用。