海门山羊生长性状相关分子标记开发及应用OA

[目的]本研究旨在筛选与海门山羊生长性状紧密相关的分子标记,包括单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失突变(InDel),深入分析这些分子标记与生长性状之间的关联,明确其对海门山羊生长发育的影响,为建立山羊精准基因标记辅助选择方法奠定基础。[方法]以海门山羊为对象,通过对已有海门山羊的全基因组测序结果进行深入挖掘和分析,利用PCR进行基因分型鉴定,筛选出与生长性状(体重、体长、体高、胸围、胸深、胸宽)相关的分子标记,并深入分析候选位点不同基因型与海门山羊生长性状之间的关联,确定对生长性状有显著影响的分子标记。[结果]MGAM(麦芽糖酶-葡糖淀粉酶)、PPP1R13B(蛋白磷酸酶1调节亚基13B)和SMAD9(SMAD家族成员9)3个基因的5个位点对海门山羊的生长发育具有显著影响。MGAM基因:12 bp InDel的位点在断奶阶段携带ID型海门山羊的胸深和胸宽显著高于DD型。在6月龄阶段,携带ID基因型的海门山羊在体重、体高、胸围和胸深上显著高于DD基因型的海门山羊;而携带38 bp InDel的DD基因型个体在6月龄阶段时体重和体高显著高于ID和Ⅱ基因型个体。此外,在6月龄阶段,携带MGAM g.15143541 T>C的CT基因型个体的体重和体长显著高于CC和TT基因型个体。PPP1R13B基因:在断奶阶段,携带58 bp InDel的ID杂合基因型个体的体长、体高和胸深显著高于DD和Ⅱ纯合基因型个体。SMAD9基因:在断奶阶段,携带16 bp InDel的Ⅱ纯合基因型个体的胸宽显著高于DD和ID基因型个体。[结论]确定了MGAM、PPP1R13B和SMAD9基因的5个位点,这些位点在海门山羊生长发育过程中具有重要作用。