2023~2024年成都地区临床碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌流行特征与耐药基因分析OA

目的分析近两年成都地区临床碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌(CRE)流行特征及耐药基因,为临床合理使用抗生素和院内感染防控提供依据。方法收集2023年1月~2024年12月期间三六三医院临床分离的所有肠杆菌科细菌(5843株),包括CRE菌株(275株)和非CRE菌株(5568株)。菌株鉴定和药敏经自动化鉴定和药敏系统进行,替加环素和多黏菌素B的药敏试验均使用微量肉汤稀释法进行。所有药敏试验操作及结果判读均遵循美国临床和实验室标准协会(CLSI)的标准。采用全基因组测序技术对CRE菌株进行碳青霉烯酶耐药基因分析。结果近两年间,CRE总分离率为4.71%,菌种分布以碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)(232/275,84.36%)和碳青霉烯类耐药大肠埃希菌(CR-ECO)(29/275,10.55%)为主;重症医学科(86/638,13.48%)和神经外科(85/630,13.49%)分离率最高。感染部位主要集中在呼吸道和泌尿道。感染患者以老年人群为主,不同年龄段CRE分离率存在显著差异(χ^(2)=18.743,P=0.001),且男性患者比例高于女性(2.97:1)。药敏试验结果表明,CRKP和CR-ECO对青霉素类、头孢类普遍耐药(耐药率:97.09%~100%),对替加环素和多粘菌素B保持高度敏感(耐药率:0.00%~13.33%),对氨曲南、妥布霉素、阿米卡星、呋喃妥因和头孢他啶/阿维巴坦的耐药率在两种菌种间存在显著差异(P<0.05)。碳青霉烯酶耐药基因检测显示,CRE碳青霉烯酶耐药基因携带率为96.40%。CRKP主要携带bla KPC-2(85/104)基因,而CR-ECO以bla NDM-5基因(5/7)为主。基因型与表型关联分析显示,携带bla KPC-2基因的菌株对阿米卡星和庆大霉素耐药率较高(74.42%、85.53%),但对头孢他啶/阿维巴坦的敏感性较高(耐药率:31.25%);携带bla NDM-5基因的菌株对头孢他啶/阿维巴坦全部耐药,而对阿米卡星和庆大霉素的耐药率较低(25.00%、53.85%);携带bla OXA-1基因的菌株对阿米卡星和复方新诺明敏感性较高(耐药率:28.57%、57.14%)。结论成都地区CRE感染尤其是CRKP引起的感染形势严峻,医院感染管理部门应加强对重症医学科、神经外科及老年男性患者群体的监测与控制。在临床治疗中,建议根据碳青霉烯酶基因型别精准选择抗菌药物,以提高治疗效果、降低患者死亡率。