基于GEO数据分析成人和青少年女性单细胞测序解析外周血单个核细胞的亚群差异OA

目的利用美国国立生物技术信息中心的基因表达数据库(GEO)中成人和青少年女性的单细胞测序数据,探究外周血单个核细胞(PBMC)与年龄相关的细胞亚群特征。方法从GEO数据库下载GSE135779中的10例女性PBMC单细胞测序数据,分为成人组和青少年组,每组5例。数据经过质控后,借助降维聚类、细胞注释、差异表达分析、拟时序分析以及细胞通讯分析等分析方法,明确与年龄相关的细胞类型及其特征。结果研究共纳入73059个细胞,分为9个细胞亚群。与青少年组相比,成年组CD8+T细胞(7.065%±1.095%vs 14.990%±1.253%)和B细胞(6.407%±0.9357%vs12.650%±1.518%)相对比例显著降低,差异具有统计学意义(t=4.761、3.501,均P<0.05)。B细胞亚群中初始B细胞在成人组相对比例显著低于青少年组(53.400%±3.189%vs 67.650%±4.530%),差异具有统计学意义(t=2.573,P<0.05)。GO富集分析表明,成人组的CD8+T细胞和初始B细胞中,上调的差异表达基因均富集在RNA剪接通路。CellChat分析显示,成人组B细胞亚群内的相互作用数量和强度均显著弱于青少年组。亲环蛋白A(PPIA)-CD147(BSG)、巨噬细胞移动抑制因子(MIF)-(CD74+CD44)信号可能是年龄相关免疫差异的关键调控节点。结论未来可从RNA剪接和调控过程,以及PPIABSG和MIF-(CD74+CD44)信号通路等方面探究女性年龄相关的免疫差异,为该领域提供了新的研究方向。