闽楠R2R3-MYB转录因子家族的鉴定与分析OA

R2R3-MYB是MYB转录因子家族中规模最大的亚组,在植物的生长发育及环境适应过程中发挥重要作用。采用生物信息学方法对闽楠(Phoebe bournei)R2R3-MYB转录因子家族成员进行系统鉴定与分析。结果显示,在闽楠基因组中共鉴定出138个R2R3-MYB转录因子成员,这些基因不均匀地分布于12条染色体上;大多数成员的不稳定系数大于40,属于不稳定蛋白。多物种共线性分析发现,闽楠与毛果杨间存在237对直系同源基因,表明闽楠R2R3-MYB家族与杨树具有较高的同源性。系统发育分析将138个成员划分为25个亚组,同一亚组的成员具有相似的保守基序组合及相同或相近的外显子数目。启动子顺式作用元件分析共鉴定出4种激素响应元件、3种胁迫响应元件、1种光响应元件和1种MYB结合位点元件。蛋白互作网络预测结果表明,与拟南芥TT2同源的PbMYB18、PbMYB21、PbMYB36、PbMYB38可能在闽楠黄酮类化合物的生物合成中发挥重要调控作用。研究结果为深入解析闽楠R2R3-MYB家族基因功能提供了理论依据和研究参考。