紫花苜蓿AP2亚家族基因鉴定、生信分析及MsBBM基因克隆OA

AP2亚家族转录因子属于AP2/ERF超家族,参与调节植物生长发育的各种生物学过程。然而,对紫花苜蓿AP2亚家族及BBM的研究未见报道。本研究基于紫花苜蓿全基因组数据,采用HMMER鉴定了10个AP2基因,其中仅有一个BBM基因,对10个AP2成员进行生信和表达分析。结果发现,AP2成员均属于不稳定、亲水的非分泌蛋白,理化性质多样,二、三级结构特异;基序分析显示,AP2基因具有保守性,含有特定的结构域,如仅BBM含有bbm-1结构域,同时含有生长发育、植物激素响应及生物和非生物胁迫响应的顺式调控元件,表明MsAP2成员具有调控植物生长发育和应对逆境胁迫的作用;表达模式分析表明,MsAP2在不同器官的表达具有多样性和特异性,具有调节紫花苜蓿生长发育的潜在功能。进一步克隆MsBBM基因,明确其编码蛋白定位于细胞核。研究结果为后续探究AP2亚家族基因在紫花苜蓿生长发育中的作用提供了参考依据,也为揭示MsBBM基因的功能提供了研究基础。