西伯利亚杏MAPK基因家族鉴定及其在低温胁迫下的表达模式分析OA
【目的】基于西伯利亚杏全基因组数据,系统鉴定MAPK基因家族成员,分析其生物信息学特征及在低温胁迫下的表达模式,揭示MAPK家族成员参与低温应答的潜在功能。【方法】以西伯利亚杏Prunus sibirica基因组数据和转录组数据为基础,通过全基因组鉴定、保守基序分析、进化树构建以及共线性分析等方法,明确MAPK家族基因的基本信息、理化性质、基因结构、系统进化关系及其在低温胁迫下的响应机制。【结果】共鉴定出84个西伯利亚杏MAPK基因,其中包括11个PsMAPK基因、10个PsMAPKK基因和63个PsMAPKKK基因,广泛分布于8条染色体上;系统发育分析显示,这些基因分为MAPK、MAPKK和MAPKKK(含MEKK、ZIK、Raf)3个亚家族,各亚家族基序保守。在44个基因的启动子区域中存在低温应答元件。低温胁迫条件下共有14个基因发生差异表达,其中PsMAPK1、PsMAPKKK2等基因的表达量随着温度的降低显著上调。【结论】通过对西伯利亚杏MAPK基因家族成员的基因结构、染色体分布及进化关系进行全面分析,明确了MAPK家族成员的理化性质和分子特征。表达分析结果表明,PsMAPK1、PsMAPKK7等14个基因参与了调控低温胁迫响应的关键信号通路。
孙春晓;王淋;敖敦;马明;陈一潇;陈俊兴;夏举国;包文泉
内蒙古农业大学林学院,内蒙古呼和浩特010000 内蒙古农业大学资源与环境学院,内蒙古呼和浩特010000中国林业科学研究院经济林研究所,河南郑州450003内蒙古农业大学林学院,内蒙古呼和浩特010000 内蒙古农业大学资源与环境学院,内蒙古呼和浩特010000内蒙古农业大学林学院,内蒙古呼和浩特010000 内蒙古农业大学资源与环境学院,内蒙古呼和浩特010000内蒙古农业大学林学院,内蒙古呼和浩特010000 内蒙古农业大学资源与环境学院,内蒙古呼和浩特010000内蒙古农业大学林学院,内蒙古呼和浩特010000 内蒙古农业大学资源与环境学院,内蒙古呼和浩特010000内蒙古农业大学林学院,内蒙古呼和浩特010000 内蒙古农业大学资源与环境学院,内蒙古呼和浩特010000内蒙古农业大学林学院,内蒙古呼和浩特010000 内蒙古农业大学资源与环境学院,内蒙古呼和浩特010000
农业科技
MAPK基因全基因组鉴定低温胁迫表达分析西伯利亚杏
《中南林业科技大学学报》 2026 (8)
P.216-228,13
内蒙古自治区自然科学基金杰出青年基金项目(2024JQ13)国家自然科学基金地区科学基金项目(32360400)。
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