不同规格日本对虾的肠道细菌群落特征分析OA

为阐明不同生长速率日本对虾(Penaeus japonicus)肠道细菌群落的差异及其与对虾生长的关系,本研究利用16S rRNA扩增子测序技术对同一养殖条件下3个规格日本对虾[大虾(体长≥9 cm)、中虾(7.5 cm<体长<9 cm)和小虾(体长≤7.5 cm)]的肠道细菌群落特征进行分析。结果表明,大虾和中虾肠道菌群的α多样性指数(如observed species指数、Shannon指数和谱系多样性)低于小虾,但其群落结构更为聚集,群落组内相似性和负/正内聚力比值的绝对值均显著高于小虾,且这些参数与对虾体长、体重呈显著正相关。3个规格日本对虾的肠道菌群主要由γ-变形菌纲、拟杆菌门、α-变形菌纲和放线菌门组成,其中γ-变形菌纲的平均相对丰度在70%以上,且在大虾和中虾中的相对丰度高于小虾。差异分析表明,大虾和中虾肠道显著富集了假单胞菌zOTU1(zero-radius operational taxonomic unit)和zOTU77、弯曲杆菌zOTU104和海绵单胞菌zOTU33等类群,而小虾肠道中显著富集了弧菌科的8个zOTU,以及摩根菌zOTU3和假交替单胞菌zOTU17等,这些类群与对虾生长速率显著相关。3个规格日本对虾肠道菌群构建均符合中性模型,但中性过程在大虾和中虾肠道菌群构建中的作用更大,且分布在中性预测范围内的zOTU相对丰度高于小虾,在大虾和中虾肠道中超出中性预测范围的zOTU主要为γ-变形菌纲、α-变形菌纲和放线菌门的细菌。本研究揭示了与对虾生长性能相关的肠道细菌群落特征,可为定向调控对虾生长提供理论依据。