1株鸡源枯草芽孢杆菌的分离鉴定及全基因组测序分析OA
试验旨在挖掘地方品种鸡肠道微生物资源,解析其潜在的益生功能基因、益生机制及安全性。以安顺高脚鸡为研究对象,定向筛选耐高温、耐胆盐的芽孢杆菌,通过形态学及16S rDNA基因序列比对完成菌株的初步鉴定,并基于Illumina HiSeq测序平台进行全基因组测序与组装,从分子水平系统解析其抑菌谱及益生潜能。结果显示,经革兰氏染色镜检,分离菌为革兰氏阳性芽孢杆菌,命名为F1。16S rDNA序列分析表明,菌株F1与枯草芽孢杆菌AU021具有高度同源性,位于系统进化树同一分支,初步将其鉴定为枯草芽孢杆菌。全基因组测序显示,菌株F1的基因组大小为4032578 bp,GC含量为44%,编码蛋白基因数量为4002个。非冗余蛋白序列(NR)数据库注释结果表明,菌株F1在物种分类上归属于枯草芽孢杆菌,与16S rDNA序列分析结果一致。直系同源蛋白簇(COG)数据库比对显示,共有3095个编码蛋白基因得到注释,其中677个基因功能未知;基因本体论(GO)数据库共注释到34个不同的功能类别;京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库共注释31类信号通路;碳水化合物活性酶(CAZy)数据库比对发现,菌株F1中有74个基因被注释。综合抗生素耐药性(CARD)数据库比对筛选到11个耐药基因;病原菌毒力因子(VFDB)数据库注释预测到7个毒力基因,但未检出致病性毒素基因;通过次级代谢产物合成基因簇分析平台(antiSMASH),发现15个与次级代谢产物合成相关的基因簇。研究表明,枯草芽孢杆菌F1具有一定的安全性及益生潜力。
王娅丽;陈佳琪;王敏乐;蒋涛;文明;温贵兰;杨颖;吴剑
贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 贵州省动物生物制品工程技术研究中心,贵州贵阳550025 贵州大学绿色农药全国重点实验室动物科学学院动物医学系兽医免疫学与绿色兽药研究所,贵州贵阳550025贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 贵州省动物生物制品工程技术研究中心,贵州贵阳550025 贵州大学绿色农药全国重点实验室动物科学学院动物医学系兽医免疫学与绿色兽药研究所,贵州贵阳550025贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 贵州省动物生物制品工程技术研究中心,贵州贵阳550025 贵州大学绿色农药全国重点实验室动物科学学院动物医学系兽医免疫学与绿色兽药研究所,贵州贵阳550025贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 贵州省动物生物制品工程技术研究中心,贵州贵阳550025 贵州大学绿色农药全国重点实验室动物科学学院动物医学系兽医免疫学与绿色兽药研究所,贵州贵阳550025贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 贵州省动物生物制品工程技术研究中心,贵州贵阳550025 贵州大学绿色农药全国重点实验室动物科学学院动物医学系兽医免疫学与绿色兽药研究所,贵州贵阳550025贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 贵州省动物生物制品工程技术研究中心,贵州贵阳550025 贵州大学绿色农药全国重点实验室动物科学学院动物医学系兽医免疫学与绿色兽药研究所,贵州贵阳550025贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 贵州省动物生物制品工程技术研究中心,贵州贵阳550025 贵州大学绿色农药全国重点实验室动物科学学院动物医学系兽医免疫学与绿色兽药研究所,贵州贵阳550025凯里市动物卫生技术服务中心,贵州凯里556000
农业科技
枯草芽孢杆菌全基因组测序次级代谢产物功能注释
《饲料研究》 2026 (10)
P.73-79,7
贵州省百千万领军人才团队项目[项目编号:黔科合人才BQW(2025)004]贵州省生态家禽产业技术体系建设项目(项目编号:GZSTJQCYJSTX-04)地方特色家禽品种收集保护及高效繁育关键技术研究与示范项目(项目编号:黔南科合[2025]2号)贵州大学自然科学专项(特岗)科研基金资助项目[项目编号:贵大领军合字(2024)12号]2024年度贵州大学校级课程思政示范项目(项目编号:kcsz2024032)贵州大学创新训练项目(项目编号:gzuxc2025043)。
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