山东省一株NADC30-like PRRSV的分离鉴定及遗传变异分析OA

2024年2月,山东省德州市某猪场猪群出现高热、呼吸困难等临床症状。采集发病猪血液和肺组织样品,采用荧光定量RT-PCR检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),并将阳性样品接种Marc-145细胞进行病毒分离培养;结合间接免疫荧光试验(IFA)、病毒滴度测定、全基因组扩增测序及序列分析,对分离株进行鉴定及遗传变异分析。结果显示,临床样品PRRSV荧光定量RT-PCR检测呈阳性,Ct值为17.77。将阳性样品接种Marc-145细胞后,经连续盲传3代可产生稳定细胞病变效应(CPE);IFA检测显示,感染细胞胞浆内出现特异性荧光;分离株病毒滴度为10^(5)TCID_(50)/mL。成功分离获得1株PRRSV,命名为SDDY-2024,其全基因组长15264 bp。序列同源性分析显示,SDDY-2024与参考株MH1210611.1、MH0688781.1和JN6544591.1具有较高的核苷酸一致性,其中与MH1210611.1和MH0688781.1的一致性分别为93.7%和93.2%。基于ORF5基因和Nsp2基因构建的遗传进化树均显示,SDDY-2024归属于PRRSV-2 Lineage 1.8,与NADC30-like参考株亲缘关系较近;ORF5区段SimPlot分析结果进一步显示,该分离株与Lineage 1.8参考株保持较高的相似性。综上,本研究从山东省德州市成功分离鉴定出1株PRRSV流行株SDDY-2024,其属于PRRSV-2 Lineage 1.8(NADC30-like),并具有一定遗传变异特征,可为当地PRRSV分子流行病学监测及防控策略制定提供参考。