莴苣类蔬菜番茄斑萎病毒的鉴定与遗传多样性分析OA
2024年春季病害调查发现,山西省和海南省种植的生菜(Lactuca sativa)及油麦菜(L.sativa var.longifolia)叶片出现褪绿、黄化和坏死等症状。为明确其病原,本研究采集8份表现典型症状的病叶样品,采用小RNA高通量测序(small RNA sequencing,sRNA-seq)技术结合逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)进行病毒鉴定。sRNA测序共获得约2329万条有效读段(clean reads),其中约354万条特异性比对至番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)基因组;通过从头组装及与NCBI Nr、NCBI Nt、GenBank Virus RefSeq Nucleotide、GenBank Virus RefSeq Protein数据库比对,初步鉴定病原为TSWV。进一步针对TSWV保守的N基因设计引物进行RT-PCR验证,所有样品均扩增出777 bp的预期条带,测序结果与组装序列一致。系统发育分析表明,山西省和海南省的TSWV分离物核苷酸同源性高达99.74%~100.00%,同属欧亚进化支,且与我国云南地区的生菜、番茄分离物亲缘关系最近。本研究首次确证TSWV可侵染山西和海南地区的莴苣类蔬菜,填补了该病毒在我国南北不同气候区莴苣类作物上的分布空白,为TSWV的分子检测、产地检疫及田间综合防控提供了重要科学依据。
李欣;储天然;孙晓东;陈贻诵;谢学文;石延霞;李改珍;孙先花;张丹;宋露;李宝聚;柴阿丽
中国农业科学院蔬菜花卉研究所/蔬菜生物育种全国重点实验室,北京100081中国农业科学院蔬菜花卉研究所/蔬菜生物育种全国重点实验室,北京100081海南省农业科学院蔬菜研究所,海南海口571100海南省农业科学院蔬菜研究所,海南海口571100中国农业科学院蔬菜花卉研究所/蔬菜生物育种全国重点实验室,北京100081中国农业科学院蔬菜花卉研究所/蔬菜生物育种全国重点实验室,北京100081山西农业大学园艺学院,山西太原030031中国农业科学院蔬菜花卉研究所/蔬菜生物育种全国重点实验室,北京100081辽宁省植保植检总站,辽宁沈阳110034辽宁省植保植检总站,辽宁沈阳110034中国农业科学院蔬菜花卉研究所/蔬菜生物育种全国重点实验室,北京100081中国农业科学院蔬菜花卉研究所/蔬菜生物育种全国重点实验室,北京100081
农业科技
番茄斑萎病毒生菜油麦菜小RNA高通量测序逆转录聚合酶链式反应系统发育分析分子鉴定
《蔬菜》 2026 (7)
P.19-26,8
海南省重点研发项目(ZDYF2024XDNY242)青海省重点研发计划(2026-NK-110)国家大宗蔬菜产业技术体系(CARS-25)中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-IVFCAAS)。
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