道地产区多年生杭白芍根际微生物群落特征OA

为研究杭白芍道地产区不同定植时间下土壤细菌、真菌、古菌的组成和结构变化,并筛选道地产区杭白芍根际的友好菌种,对浙江省东阳市1、2、3、4 a生的杭白芍根际土壤样品进行微生物菌群结构分析,解析杭白芍定植过程中根际土壤的微生物组成特征及演替规律,同时利用EggNOG、KEGG和CAZy数据库进行菌群功能预测。结果表明:杭白芍根际土壤微生物组成主要为细菌(85.561%~91.680%)、古菌(0.481%~2.804%)、真菌(0.018%~0.030%)、病毒(0.022%~0.117%),其他微生物占比为7.516%~11.500%。随着定植时间的增加,部分劣势菌群逐渐丧失,菌群多样性降低,细菌相对丰度升高,1 a生杭白芍根际土壤细菌相对丰度为85.561%,4 a生时达到91.680%;古菌与病毒的相对丰度下降,1 a生时分别为2.804%和0.117%,4 a生时分别降至0.481%和0.022%;真菌的相对丰度先升后降,1 a生时为0.018%,3 a生时达到峰值(0.030%),4 a生时下降至0.024%。此外,Candidatus Rokubacteria和硝化螺旋菌属(Nitrospira)为道地产区多年生杭白芍根际的标志物种。上述结果表明,在杭白芍道地产区,随着定植时间的累积,菌群多样性降低,并招募和富集了Candidatus Rokubacteria、硝化螺旋菌属等特征菌种。