基于生物信息学探索炎症性肠病和肌少症潜在相关基因特征及途径分析OA

基于生物信息学探讨炎症性肠病(Inflammatory bowel disease, IBD)与肌少症潜在的生物联系,为IBD合并肌少症的诊断和治疗提供新思路。从GEO数据库提取肌少症和IBD的数据集,筛选出共表达基因,并进行功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)、转录因子(TF)-基因相互作用网络和TF-miRNA协同调节网络的构建,最后通过DSigDB数据库预测药物分子。本研究共筛选到304个共表达基因,通过功能富集分析和PPI网络分析,得到3个关键基因(ICAM1、CXCL12、JUN),基于TF-基因相互作用网络和TF-miRNA相互作用网络分析,得出共21个miRNAs和17个TF共同参与肌少症和IBD的相互作用。在药物预测方面的分析结果表明,芹菜素、姜黄素等药物可能是治疗IBD合并肌少症的潜在药物分子。