基于失巢凋亡相关lncRNAs的头颈鳞癌新型预后模型构建与验证OA

为探讨失巢凋亡相关lncRNAs(Anoikis-related lncRNAs, ARLs)在头颈鳞癌(Head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)中的预后价值并构建预后和免疫活性模型,从癌症基因组图谱(The cancer genome atlas, TCGA)数据库下载HNSCC患者的转录组数据(RNA-sequencing, RNA-seq)和临床资料;利用生物信息学方法筛选预后相关ARLs,构建预后模型并验证其准确性,随后检测其相关免疫浸润情况;最后通过一系列体外实验验证数据库分析结果的准确性。预后模型包括6个ARLs,具有较高的预测HNSCC患者预后效能,可作为HNSCC患者独立预后因素,且该模型可以用来预测患者免疫活性。此外,实时荧光PCR(real-time PCR,RT-PCR)结果与数据集分析结果一致。流式分析结果显示,ARLs显著影响HNSCC细胞失巢凋亡(P<0.01)。研究表明构建的ARLs是一个新且高效的预后和免疫活性预测模型,为失巢凋亡在HNSCC临床预后中的研究奠定基础。