核桃黑斑病生防链霉菌WMF106全基因组测序及分析OA
核桃黑斑病是核桃生产中最严重的细菌性病害,化学防治易造成污染与抗性问题,亟需绿色高效生防资源。菌株WMF106是对核桃黑斑病菌具有较强拮抗活性的暗蓝色链霉菌(Streptomyces caeruleatus)。为进一步了解该菌株的生防遗传基础,解析其防治核桃黑斑病的分子机理,本研究对菌株WMF106进行全基因组测序与功能分析。采用二代+三代测序技术组装基因组,进行基因预测、功能注释及次级代谢产物合成基因簇挖掘。结果表明:菌株WMF106基因组由1条染色体(染色体基因组总长度10,377,577 bp,GC含量为71.16%)和2个质粒组成,共预测编码基因9253个;在NR、eggNOG、Swissport、KEEG、GO、CAZy、TCDB、CARD、PHI、VFDB数据库中注释到的基因分别为8981、7933、5787、2979、6426、510、1319、142、7和1507个。共鉴定出36个次级代谢产物合成基因簇,其中10个与已知抗菌物质基因簇同源性达90%~100%,包括覆盖霉素、1,3,6,8-四羟基萘、铁载体coelichelin、ε-聚赖氨酸等。基因组不含典型毒力因子,生物安全性高。本研究明确了菌株WMF106的遗传背景与生防潜力,为挖掘新型抗菌活性物质、研发核桃黑斑病生物防治制剂提供了重要基因资源与理论支撑。
瞿佳;赵玲侠;门欣;孙晓宇;陈锐;宁硕瀛
陕西省微生物研究所,西安710043陕西省微生物研究所,西安710043陕西省微生物研究所,西安710043陕西省微生物研究所,西安710043陕西省微生物研究所,西安710043陕西省秦岭生态安全重点实验室陕西省动物研究所,西安710032
农业科技
暗蓝色链霉菌核桃黑斑病全基因组测序基因注释次级代谢生物防治
《中国农学通报》 2026 (12)
P.144-154,11
陕西省自然科学基金“绿针假单胞菌SF12防治石榴干腐病的生防机理研究”(2025JC-YBQN-229)陕西省重点研发计划一般项目“陕西道地中药材种植基地重金属-抗生素-抗性基因污染特征分析及微生物土壤修复剂开发与示范”(2023-YBNY-236)“根结线虫微生物农药紧密帚枝霉缓释颗粒剂的创制与应用研究”(2024NC-YBXM-052)“石榴蓟马抗药性监测与绿色防控技术研究”(2024NC-YBXM-057)陕西省创新能力支撑计划项目“陕西省微生物资源平台升级建设”(2024CX-GXPT-02)陕西省科学院科技计划项目“陕西石榴病虫害绿色防控技术研究与应用”(2023k-11)“陕西省微生物资源平台升级建设”(2025k-39)西安市农业技术研发项目“西安市访花昆虫资源与优势物种授粉效果研究”(23NYGG0023)“石榴果园土壤改良关键技术研究”(24NYGG0099)“石榴绿盲蝽抗药性监测与防控技术研究”(25NJSYB00042)。
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