番茄SlRR基因家族的鉴定及表达与互作分析OA

反应调节因子(RR)蛋白是细胞分裂素信号转导途径中的关键组分,具有接收/响应上游激素信号,调控下游基因表达等功能,在番茄生长发育及细胞分裂素调控通路中发挥重要作用。基于番茄SL 4.0基因组及蛋白组数据,利用ScanProsite基序搜索和InternPro结构域分析等工具,鉴定得到33个番茄SlRR家族成员,并依据与拟南芥ARR/APRR的系统进化关系及蛋白结构域组成,将其分为A型、B型、C型、Clock型PRR、B型PRR 5类。其中,A型、B型SlRR分别包含7、10个成员;B型SlRR除RR结构域外,均含有1个Myb-type DNA结合域,很可能具有转录因子功能。多数SlRR基因位于番茄染色体两端5 Mb的相对高基因密度区。SlRR基因启动子中广泛富集光、激素、胁迫类响应元件,且全部A型和B型SlRR启动子中均含有B型RRs蛋白结合元件。多数A型SlRR的表达量在果实发育早期最高,随发育阶段的推进逐渐下降;而多数B型SlRR在果实发育中期或成熟中后期的表达量最高,显示了2类SlRR在番茄果实中的不同表达模式与功能。酵母单杂交试验表明,B型SlRR21与SlRR22可与生长素转运基因SlPIN3启动子直接结合。综上,本研究对番茄SlRR基因进行了鉴定、分类与特征分析,为揭示其在番茄生长发育及细胞分裂素与其他激素互作中的功能提供了参考。