桑黄OSC基因鉴定及密码子偏好性分析OA

为了解桑黄(Sanghuangporus sanghuang)中2,3-氧化鲨烯环化酶(OSC)基因的生物信息及与食药用菌密码子偏好情况,从全基因组数据、生物信息学及密码子偏好性等方面开展分析.结果表明,S.sanghuang基因组中存在2个OSC基因(ShOSC1、ShOSC2),ShOSC1、ShOSC2分别编码301、592个氨基酸的蛋白,且均含有ISOPREN_C2保守结构域;ShOSC1为不稳定的亲水性蛋白,而ShOSC2为稳定的微疏水性蛋白;系统进化分析发现,ShOSC与动植物同源蛋白形成独立进化分支,ShOSC2与暴马桑黄(Sanghuangporus baumii)的羊毛甾醇合酶具有高度同源性,ShOSC1蛋白在进化树上形成独立分支,结合结构特征ShOSC1可能具有香叶基转移酶活性,提示ShOSC在代谢合成过程中可形成更为多样的萜类化合物;密码子偏好性分析显示,ShOSC基因密码子偏好性较弱,GC3呈现微弱A/T偏好,整体序列偏向G/C组成;密码子偏好性强度评估中,7种食药用菌OSC密码子偏好性整体较弱,仅S.baumii GC3呈现A/T偏好,推测桑黄属OSC基因在进化过程中可能保留了独特的A/T结尾密码子偏好性;在进化过程中食药用菌OSC基因的密码子使用偏好性由突变压力与自然选择协同驱动;在Sh0SC异源受体适配度比较中,大肠杆菌表现出最佳适配性,为较适宜的异源表达系统.