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毛果杨PEBP基因家族鉴定及表达分析OA

中文摘要

本研究通过全基因组分析在毛果杨中鉴定出 8 个 PEBP 基因家族成员(PtPEBP1 至 PtPEBP8),系统解析其染色体分布、理化性质及分子进化特征.染色体定位显示,该家族呈现不均匀分布,10 号染色体存在 3 个成员的基因簇.蛋白理化性质分析表明,成员间等电点差异显著(5.56~9.47),均为亲水性胞质蛋白.系统发育分析将其划分为 FT-LIKE、TFL1-LIKE 和 MFT-LIKE3 个亚家族,保守基序分析发现 Motif 3 为家族核心元件.启动子分析揭示了 37 个顺式作用元件,其中 PtPEBP5 至 PtPEBP8 富含胁迫响应元件.共线性分析表明,基因复制是家族扩张的重要驱动力.蛋白结构预测显示,无规则卷曲为主要二级结构,占比 50.57%~55.56%.组织表达谱显示出成员的表达具有器官特异性:PtPEBP1 和 PtPEBP7 在茎节高水平表达,PtPEBP3 和 PtPEBP8 表达偏好根部,PtPEBP4 和 PtPEBP5 在叶片优势表达.本研究为解析木本植物 PEBP 家族的功能分化及分子调控网络提供了理论基础.

刘英;梁杰雄;李碧如;段栩栩;廖百明;勾啸

广州市石门国家森林公园管理中心,广东 广州 510000广州市白云园林建设工程有限公司,广东 广州 510000广州市白云园林建设工程有限公司,广东 广州 510000广州市白云园林建设工程有限公司,广东 广州 510000广州市白云园林建设工程有限公司,广东 广州 510000广州市林业和园林科学研究院,广东 广州 510000

毛果杨PEBP基因家族生物信息学分析组织表达

《现代农业科技》 2026 (11)

5-10,18,7

10.3969/j.issn.1007-5739.2026.11.002

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