分子对接与网络药理学分析砂淋汤调控晶体稳态平衡:活性成分及多靶点机制OA

背景:中药砂淋汤可显著抑制晶体形成。现有研究初步揭示了砂淋汤组方药材的多靶点调节潜力,但其明确的药效背后蕴藏着尚未被清晰揭示的系统性调控网络。目的:采用网络药理学与分子对接算法,明确砂淋汤的潜在活性成分、作用靶蛋白及其相互作用关系,揭示砂淋汤治疗肾结石的潜在分子机制。方法:从TCMSP数据库(中药系统药理学数据库与分析平台)中检索砂淋汤的化合物成分,并筛选出潜在的类药分子及相关药物成分。基于GeneCard数据库中与肾结石相关的基因,确定砂淋汤的潜在作用靶点。随后,利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,并提取核心节点进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书KEGG通路富集分析。通过BioGPS数据库分析核心基因在组织器官中的表达分布。此外,采用分子对接技术可视化潜在靶蛋白与对应化合物之间的结合亲和力。结果与结论:通过TCMSP数据库筛选得到砂淋汤的15个潜在活性药物成分及74个作用靶蛋白。蛋白质-蛋白质相互作用网络分析显示,白细胞介素6(IL6)、半胱天冬酶3(CASP3)、肿瘤坏死因子(TNF)、原癌基因蛋白JUN(JUN)、B细胞淋巴瘤2蛋白(BCL2)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、转化生长因子β1(TGFB1)和原癌基因蛋白FOS(FOS)为度值最高的核心节点。富集分析结果表明,这些靶基因与肾结石相关的基因本体功能条目及京都基因与基因组百科全书KEGG通路存在显著关联。此外,分子对接结果显示,氢键和疏水相互作用是活性成分与靶蛋白实现稳定结合的关键作用方式。