基于DLAT与KASII基因SNP标记鉴定奇楠种质与普通白木香种质OA

奇楠种质与普通白木香种质在结香特点、品质与市场价值上存在显著差异。为实现二者的快速、准确鉴别,本研究拟基于全基因组重测序技术筛选特异性SNP标记,建立一套沉香种质鉴定方法。选取市场主要流通的13份奇楠种质样品和50份普通白木香种质样品进行全基因组重测序,通过计算群体内纯合度(Hp)与群体间分化指数(Fst),初步筛选出在两类群体中均完全固定(H_(p)=0)且完全分化(Fst=1)的SNP位点,经功能注释后进一步筛选出导致非同义突变的功能基因位点作为候选标记,最终确定位于DLAT基因第1879位点与KASII基因第20位点的2个SNP,其在奇楠种质与普通白木香种质中表现出相反的基因型:所有奇楠种质在2个位点均为纯合TT型,而所有普通白木香种质分为CC型(DLAT)与AA型(KASII)。为验证标记的准确性和普适性,本研究进一步采集5份奇楠新种质与2份普通白木香新种质,通过PCR扩增与Sanger测序进行基因分型,结果与预期完全一致,证实所选SNP标记具备良好的准确性与可靠性。本研究构建了一套基于DLAT和KASII基因SNP标记的沉香种质鉴定方法,实现了分子层面对奇楠种质与普通白木香种质的快速准确识别,为沉香产业的良种选育与市场监管提供技术支撑。