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人工智能助力蛋白质翻译后修饰的质谱解析及其临床应用OA

中文摘要

蛋白质翻译后修饰(PTM)作为调控蛋白质功能、拓展生命复杂性的核心分子开关,在细胞信号转导、代谢调控及疾病发生发展中扮演着重要角色。然而,PTM固有的低丰度、高动态范围以及化学结构的异质性(尤其是高度复杂的糖基化修饰),严重制约了对其进行全面、深度的解析。尽管基于质谱(MS)的蛋白质组学已成为该领域的主流技术,但传统分析流程在富集特异性、修饰位点精准定位以及对数据库依赖性等方面仍面临显著的技术瓶颈。本综述系统梳理了磷酸化、糖基化及赖氨酸酰化等关键PTM的生物学功能、经典分析策略及其局限性。在此基础上,重点探讨了人工智能(AI),尤其是深度学习算法在突破上述技术壁垒中的应用潜力;详细论述了AI驱动的计算范式如何通过构建高精度的谱图库预测模型、优化位点定位算法(如降低假阳性率)以及开发不依赖数据库的复杂糖肽鉴定策略,从而显著提升PTM分析的覆盖度与准确性。本文进一步阐述了这些新兴技术在临床转化中的实际价值,重点列举了其在膀胱癌尿液外泌体诊断标志物筛选、KRAS突变肺癌磷酸化信号网络解析及胰腺癌耐药机制研究中的突破性进展。展望未来,随着AI算法与单细胞蛋白质组学及多组学数据的深度融合,以及新材料、新富集策略的不断发展,不仅将有助于系统揭示PTM的时空动态调控规律,更将为精准医学背景下的疾病早期诊断与靶向治疗提供强有力的技术支撑。

谢欣然;杨晓霞;申华莉;林灵

复旦大学上海医学院,上海200032复旦大学上海医学院生物医学研究院,上海200032复旦大学上海医学院生物医学研究院,上海200032复旦大学附属中山医院上海心血管病研究所,上海200032

化学化工

蛋白质翻译后修饰(PTM)质谱(MS)人工智能(AI)谱图解析临床应用

《质谱学报》 2026 (3)

P.361-379,I0003,20

上海市自然科学基金(24ZR1410800)上海市计算生物学重点专项(23JS1400100)。

10.7538/zpxb.2025.0119

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