棕榈酸诱导HepG2细胞脂毒性模型的深度蛋白质组学OA

由持续性脂质暴露诱导的肝脏脂毒性(hepatic lipotoxicity)已成为影响人类健康的重要问题。以棕榈酸(palmitic acid,PA)处理的人源性肝癌细胞系HepG2是该领域广泛应用且成熟的体外实验模型。然而,针对该模型的深度组学数据资源仍相对匮乏,从而限制了相关生物学机制的系统解析及潜在治疗靶点的发现。本研究采用3种蛋白质组学样品制备策略,即过滤辅助样品制备(filter-aided sample preparation,FASP)法、溶剂沉淀辅助的单管固相增强样品制备(solvent precipitation,single-pot,solid-phase-enhanced sample preparation,SP4)法以及基于沉淀的溶液内酶解(precipitation-based in-solution digestion)法,全面描绘PA处理HepG2细胞的蛋白质组学变化,并提升差异表达蛋白(differentially expressed proteins,DEPs)鉴定的准确性与可靠性。功能富集分析结果表明,PA处理后,上调蛋白显著富集于细胞外基质组织、黏着斑、补体与凝血级联反应、脂肪酸代谢及PPAR信号通路,而下调蛋白主要富集于核糖体与剪接体相关通路。本研究不仅系统性地鉴定并扩展了HepG2细胞脂毒性模型中的潜在治疗靶点,还从转录因子活化、细胞器功能障碍以及钙离子稳态失衡等方面揭示了新的分子机制,为脂毒性及肝毒性相关研究提供了重要的数据支撑与理论参考。