甲醇介导的多膜集成过滤装置用于多组学样品的快速制备OA

高质量多组学数据的生成对样本制备技术的严谨性与可靠性提出了极高要求。然而,当前该领域仍缺乏可同时兼顾高效、快速与稳定的多组学样品并行制备策略。本研究开发了甲醇介导的多膜集成过滤装置用于蛋白质组与代谢组样品并行快速制备(3M-Filter)的策略,该方法处理细胞样品无需借助超声裂解辅助,不仅缩短了额外的处理时间,而且避免了下游污染。凝胶电泳实验证明,3M-Filter适用于细胞、组织及体液等多种类型样品的蛋白质捕获及代谢物小分子的同步提取。以HeLa细胞为模式样本,在相同蛋白质起始量下,3M-Filter在蛋白质和多肽的鉴定深度、重复性、定量准确性、酶切效率及处理速度等方面均优于溶液酶切、过滤器辅助样品制备(FASP)和单管固相增强样品制备(SP3),且适用于低至5000个细胞的微量样品。与基于裂解液的蛋白质提取方法相比,3M-Filter在蛋白质与多肽的鉴定数量上更具优势,且定量精度更高,同时显著降低了氧化副反应修饰的发生率。3M-Filter的关键优势是可在支持深度细胞蛋白质组分析的同时,实现对细胞小分子代谢物的高覆盖检测(超过2000个谱图特征)。综上,3M-Filter适用于珍贵临床样本的多组学样品制备,为大规模队列分析提供了新的样品制备方案。