高粱Waxy基因的生物信息学与表达模式分析OA

高粱的直链淀粉和支链淀粉由Waxy基因控制,Waxy基因高表达时,籽粒淀粉为直链淀粉,Waxy基因低表达时,籽粒淀粉则为支链淀粉.为了研究Waxy基因在高粱生长发育中的功能及组织表达特异性规律,利用生物信息学分析的方法和qRT-PCR技术对其进行研究.生物信息学分析结果表明,Waxy基因位于10号染色体上,其CDS区域的序列长度为1 827 bp,编码608个氨基酸,该蛋白亚细胞定位于叶绿体上,是一种缺少的信号肽非跨膜亲水稳定蛋白,进化树分析显示高粱与水稻、水稻籼稻组之间的亲缘关系更近.组织表达特异性分析结果表明,Waxy基因在粳高粱和糯高粱中同一部位不同生长时期的基因相对表达量不同,在粳性高粱品种三尺三中表现为花后20 d＞花后25 d＞花后15 d＞花后30 d,在糯性高粱品种青壳洋中表现为花后15 d＞花后10 d＞花后20 d＞花后25 d;Waxy基因在不同类型高粱品种同一生长时期不同部位的表达规律相似,均表现为旗叶部位的相对表达量最高.通过对高粱Waxy基因进行生物信息学分析和表达模式分析,探明其在粳高粱和糯高粱中的功能,可为酒用高粱的品质改良和良种选育提供科学理论基础.